La producción de bioetanol celulósico es la gran esperanza para que a medio plazo se pueda utilizar como materia prima para los biocarburantes la paja de cereales, caña del maíz u otros materiales celulósicos, en lugar del grano.

Sin embargo, la posibilidad de utilizar pajas y cañas no está exenta de problemas, ya que extraerlos para su utilización industrial en lugar de incorporarlos al terreno, supone privar al terreno de una importante fuente de materia orgánica, necesaria para mantener la fertilidad del suelo y prevenir la erosión, siendo necesario tener en cuenta esta cuestión para una producción verdaderamente sostenible.

Según estudios realizado por el Servicio de Investigación Agraria de EEUU (ARS) en el caso del maíz, la cantidad de cañas que se puedan recolectar se verá muy limitada por el riesgo de erosión del suelo, la rotación de cultivos que se realice y la adición de materia orgánica al suelo que se pueda dar por otras vías, incluyendo la posibilidad de utilizar residuos de la misma industria del bioetanol.