Al igual que sucede con la leche líquida, España importa más queso de lo que exporta. En los últimos cinco años, cada vez ha ido importando más y exportando menos, con lo que la balanza comercial ha ido siendo cada vez más negativa. Entre enero y septiembre de 2004, España importó 140.00 tn y exportó 42.000 tn. Cinco años más tarde, las exportaciones de enero a septiembre se habían incrementado en 32.000 tn y las importaciones se habían reducido en 13.000 tn, de acuerdo con los datos de aduanas recogidos en una presentación de Cooperativas Agroaliemtnarias.

Solo con Portugal, España exporta más que lo que importa. En el período comprendido entre octubre de 2008 y septiembre de 2009, España mandó para Portugal 45.000 tn de queso y entraron 12.000 tn de queso portugués. Con Francia y Alemania, que son los otros dos principales mercados para los intercambios de queso, la balanza resulta negativa para España. Entre octubre de 2008 y septiembre de 2009, el balance fue de -64.000 tn en el caso de Francia y de -44.000 tn en el caso de Alemania.